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Non non, c’est bien marqué sur le titre qu’il doit être imprimé sur papier A4 pour être valide : http://lehollandaisvolant.net/img/Capture-ebilletpdf.png

Un contrôleur, au vu de ce qui est écrit, peut très bien refuser le flashcode sur l’écran du téléphone et vous verbaliser.
Je n’ai jamais eu de problèmes en laissant le flashcode sur mon téléphone, cependant. Donc visiblement, ils acceptent cette pratique à plus ou moins de tolérance.

Regarde là : http://sosconso.blog.lemonde.fr/2012/12/07/vous-prenez-le-train-evitez-le-e-billet/
Un témoignage d’un gars (3e paragraphe) qui a dû payer une amende car son billet n’était pas imprimé.
(la fin de l’article donne aussi la réponse de la SNCF : le QRCode sur le téléphone n’est pas accepté officiellement).

Il existe aussi des billets achetés via l’application Voyage-sncf, qui eux peuvent (c’est explicitement indiqué) être présentés depuis l’application sur son smartphone mais ça porte un autre nom : "m-billet" et ça n’existe que sur le TGV et sur certains trajets uniquement.