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Dans Ubuntu 10.10, je ne sais pas, mais dans Linux Mint 10 les dépôts officiels sont prioritaires sur les dépôts tiers.

Pour remettre tous les dépôts à égalité, et faire en sorte que le numéro de version compte plus au lieu de la source :

sudo mv /etc/apt/preferences /etc/apt/preferences.BAK

Exemple avec le navigateur Opera : les sources de Mint proposent actuellement la version 10.62. Opera propose la version officielle 10.63. Or, si on ajoute le dépôt et la clé, Opera ne sera pas mis à jour car c'est la version de Linux Mint qui sera prioritaire.

Même chose pour Virtual Box, Wine et tous les autres.

En soit c'est sécuritaire : l'ajout de PPA à gogo est un risque de sécurité, et on ne devrait toujours faire que confiance aux dépôts officiels, mais quand ces derniers ne sont jamais à jours (et c'est toujours le cas, malheureusement) il est nécessaire d'ajouter un dépôt tierce-partie.